环保型高分子材料国家地方联合工程实验室是由国家发改委2009年批准的首批国家地方联合工程实验室，是我国在环境友好材料领域开展基础科学研究与应用技术研究的重要研究基地。实验室创建于1994年，由当时的校降解与阻燃高分子材料研究中心，先后发展成为四川省高校重点实验室、教育部工程研究中心、四川省工程实验室和国家地方联合工程实验室。现在还是”111”引智基地、四川省的国际合作基地，也是2011协同创新中心的牵头单位，建立了完备的高分子合成、加工、表征等研究手段和设备仪器及设施。

省部共建教育部现代光学技术重点实验室是江苏省教育厅于2000年批准建立的面向国内外开放的省级重点实验室，2004年获批成为江苏省国家重点实验室建设培育点，2005年成为教育部重点实验室。实验室位于位于苏州大学本部，总面积达10000平方米，其中超净实验室3000平方米。

2018年9月10日，科学技术部、江苏省人民政府批准建设省部共建放射医学与辐射防护国家重点实验室，这是江苏省首个省部共建国家重点实验室，实现了苏州市和苏州大学国家重点实验室零的突破。